微滴式数字PCR系统在传统的PCR扩增前对样品进行微滴化处理,即将含有核酸分子的反应体系分成成千上万个纳升级的微滴,其中每个微滴或不含待检核酸靶分子,或者含有一个至数个待检核酸靶分子。经PCR扩增后,逐个对每个微滴进行检测,有荧光信号的微滴判读为1,没有荧光信号的微滴判读为0,根据泊松分布原理及阳性微滴的个数与比例即可得出靶分子的起始拷贝数或浓度。
微滴式数字PCR系统技术优势,:
单分子分析:将微量临床样本再细分成 2 万个微滴,实现临床样本的“单分子分析”。
真正意义上的绝 对定量,可统计突变率:无需标准曲线;检测下限可低至单拷贝;不依赖ct值,不依赖扩增效率,能克服 PCR 抑 制剂的影响。
不再依赖Cq值或内参基因,即可确定低至单拷贝待检靶分子的绝 对数目。(Cq值:PCR扩增过程中,扩增产物(荧光信号)到达阈值(进入指数增长期)所经过的扩增循环次数)。
数据分析自动化:每个微滴的检测结果以阴性、阳性标示,由设备直接判断,通过把样本稀释成许多部分,然后在一个反应发生的时候对其计数。灵敏度可高达0.001%,显著高于扩增阻滞突变系统(0.1%)和sanger法测序(10%)。
克服了传统PCR系统高成本、通量有限、流程复杂、精确度低等缺点。
使用灵活:可按实验需要调整通量和灵敏度。
微滴式数字PCR系统的应用:定量癌症标志物、区分基因组变异、研究病毒载量、新一代测序的验证、基因表达分析
总体来说,ddPCR的优点就是能够准确灵敏地检测出微量基因的变化及差异,提供给我们更可靠的数据,尤其是在临床医学研究领域其作用非常重要。
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